Представления и предписания, решения и действия (бездействие) Счетной палаты Чукотского автономного округа и ее должностных лиц могут быть обжалованы в судебном порядке.
Порядок обжалования представлений и предписаний, решений и действий (бездействия) Счетной палаты Чукотского автономного округа и ее должностных лиц, регламентирован главой 24 Арбитражного процессуального кодекса Российской Федерации, главой 22 Кодекса административного судопроизводства Российской Федерации.
Проверяемые органы и организации и их должностные лица, в соответствии с частью 2 статьи 17 Федерального закона от 7 февраля 2011 года №6-ФЗ «Об общих принципах организации и деятельности контрольно-счетных органов субъектов Российской Федерации, федеральных территорий и муниципальных образований» вправе обратиться с жалобой на действия (бездействие) Счетной палаты Чукотского автономного округа в Думу Чукотского автономного округа.